När en person går in i tjänst i Sjukhuskyrkan förväntas att medarbetaren påbörjar ”Sjukhuskyrkans kompetensprogram – en själavårdsutbildning i fyra steg”. Syftet med utbildningen är att ge en fördjupad kompetens i själavård och krisstöd. Detta utgör ett led i arbetet med att kvalitetssäkra Sjukhuskyrkans arbete.

Sjukhuskyrkans medarbetare har präst- pastors- diakonutbildningar etc. inom respektive trossamfund. Många av medarbetarna har utöver sina grundutbildningar fördjupade utbildningar inom själavård, psykoterapi eller som handledare.